在藥廠內，無論是從事藥品生產的凈化車間，還是培育實驗動物的實驗動物房，我們都要對其進行嚴格的管理，下面我們談下實驗動物房潔凈室的人員動物管理原則。
一、人員管理
人既是潔凈空氣的污染源，又是直接接觸動物的污染源。因此，人員的管理直接影響飼養效果。實驗動物房的飼養工作一般由專人負責。小規模或根據實驗要求進行的飼養，有時也由實驗人員兼任。人員管理應包括進入飼養室的所有人員。而在實際的管理中，往往可能忽視對專職實驗研究人員的管理，在這方面應引起注意。
飼養設施采用隔離系統時，人員不進入潔凈室，所以，不需要特殊的凈化和更衣，而通過隔離器上的操作手孔及手套進行操作。管理動物的操作比較精細，手套不宜太厚。工作人員需要經常修剪指甲，工作前還應摘下戒指、手表等物，以免劃破手套、當飼養設施采用負壓隔離器時，工作人員在結束工作后，應消毒雙手，以防感染。
二、動物管理
實驗動物（除無菌動物外）搬進正壓隔離系統時都必須從其他隔離器設施中轉送過來。其操作程序是:把實驗動物裝在箱內，在傳遞窗中進行表面消毒后，進入屏障系統的潔凈室，然后開箱取出。實驗動物進入亞屏障系統和開放系統的飼養室，可不經過特殊處理，但應盡可能使動物不受污染。為降低實驗動物的交叉感染率，實驗動物飼養室，應對管理操作步驟做出規定。
污染區域或空間中的動物尸體，經高壓蒸汽滅菌處理后方可送出。有的動物尸體需要直接焚燒。